1997年，一场金融风暴突然降临，并迅速蔓延整个亚洲，受其影响最大的东南亚经济几乎陷入了绝境。而林绍良所面临的更是一场关乎生死存亡的考验，这其中既有经济危机的严重冲击，也有社会政治的激流暗涌，还有竞争对手的落井下石，明争暗斗、趁火打劫，凡是能想象到的困难，都在此时重重压来。
　　
　　一方面，因为企业集团规模庞大，业务遍布风波所及之处，而且贷款基本上是美金，应收账款却是印尼盾等当时跌值最快的东南亚货币，因此，林绍良集团的资金严重缩水，损失惨重。
　　
　　而另一方面，饱受冲击的印尼经济，激化了国内潜伏已久的各种矛盾，经济危机迅速演变为政治危机和社会危机。1998年5月，印尼爆发了旨在推翻苏哈托独裁统治的大规模群众抗议示威活动，强权的苏哈托倒台了，其家族财产面临清算，与之相关的企业也受到了牵连，与苏哈托保持了近半个世纪亲密关系的林绍良和他的企业集团自然首当其冲地被置于风口浪尖，成为被打击报复的对象。
　　
　　苏哈托下台仅仅几天，印尼的紧张局势虽有所缓和，但林绍良的压力丝毫未减。由于苏哈托的两个子女在中央亚细亚银行拥有30％的股份，导致了“中亚银行”的存款挤提。在雅加达和其他城市的“中亚银行”分行门前，前去提款的人每天都是大排长龙，“中亚银行”在十多天中存款流失约11.5亿美元。鉴于“中亚银行”的规模及重要性，曾有四家私营银行想协助其解决大量存户的提款问题，最后终因“负担沉重”而放弃。最终，凝结着林绍良最大心血的“中亚银行”被收归国有。
　　
　　印尼的金融危机和苏哈托的下台，不仅只关系到林绍良涉足的银行业，几乎是在转眼之间，三林集团主要的企业都由赢利转为亏损，其中“印尼水泥公司”外债达8亿美元，“印尼食品公司”外债更是达到了10亿美元之巨，林绍良不得不将许多资金调离印尼。
　　
　　为了清偿政府9亿美元的债务，林绍良将印尼的三个最大的企业——世界最大的方便面食品企业“印多福”、亚洲最大的水泥厂“印多水泥”和汽车工业“印多汽车”一一出卖。其中“印多水泥”和“印多汽车”被政府转售给外资，“印多福”则由第一太平集团动用6.5亿美元出面收购40％的股份，控制权仍然在林氏家族手上。对于此时的林绍良来说，最大的期望就是企业能生存下来，至于发展壮大企业，已经不敢再去想了。
　　
　　“屋漏偏逢连夜雨”，就在林绍良的企业集团陷入了关乎生死存亡的巨大危机之时，骚动的印尼又发生了恶性排华事件。林绍良作为印尼华商领袖，自然成为了被攻击的头号目标，暴徒不仅大肆抢劫其分布在印尼各地的银行及公司的现金与财产，还放火焚烧了他位于雅加达的私人宅邸，其中，停在宅邸内的五辆汽车被彻底烧毁，一些重要的企业文件和家庭生活照片亦遭到毁坏，林绍良个人的大幅彩色画像也被暴徒抢去损毁。他的城市酒店更是被烧得面目全非。